Origine approssimativa di SARS-CoV-2

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SARS-CoV-2 è il settimo membro dei Coronaviridae noti per infettare l’. Tre di questi virus, SARS CoV-1, MERS e SARS-CoV-2, possono causare gravi malattie; quattro, HKU1, NL63, OC43 e 229E, sono associati a lievi sintomi respiratori.

Qui, esaminiamo ciò che può essere dedotto sull’origine e l’evoluzione precoce di SARS-CoV-2 dall’analisi comparativa dei dati disponibili sulla sequenza del genoma.

In particolare, offriamo una prospettiva sulle caratteristiche notevoli del genoma SARS-CoV-2 e discutiamo scenari in base ai quali queste caratteristiche potrebbero essere sorte.

È importante sottolineare che questa analisi fornisce la prova che SARS-CoV-2 non sembra costruito in laboratorio né sembra un virus appositamente manipolato.

Il confronto genomico di alfa e betacoronavirus (famiglia dei Coronaviridae ) descritti di seguito identifica due importanti caratteristiche del genoma SARS-CoV-2: (i) basato sulla modellazione strutturale e sui primi esperimenti biochimici.

SARS-CoV-2 sembra essere ottimizzato per vincolante per il recettore ACE2 umano; (ii) la proteina spike (S) altamente variabile di SARS-CoV-2 ha un sito di scissione polibasico (furina) ai confini S1 e S2 attraverso l’inserimento di dodici nucleotidi.

Inoltre, questo evento ha portato all’acquisizione di tre glicani O-predetti previsti intorno al sito di scissione polibasico.

Le prime analisi indicano che i pangolini malesi ( Manis javanica) importato illegalmente nella provincia del Guangdong contiene un CoV simile al SARS-CoV-2 18,19. Sebbene il virus del pipistrello RaTG13 rimanga il parente più vicino a SARS-CoV-2 in tutto il genoma, il CoV pangolino malese è identico a SARS-CoV-2 in tutti e sei i residui chiave di RBD (Figura 1).

Tuttavia, non è stato ancora identificato alcun CoV di pangolina sufficientemente simile alla SARS-CoV-2 in tutto il suo genoma per supportare l’infezione umana diretta.

Inoltre, il pangolino CoV non porta un inserimento polivinico nel sito di scissione.

Affinché un virus precursore acquisisca il sito di scissione polibasico e le mutazioni nella proteina del picco adatte al legame del recettore ACE2 umano, un ospite animale dovrebbe probabilmente avere un’alta densità di popolazione – per consentire alla selezione naturale di procedere in modo efficiente – e un gene ACE2 che è simile all’ortoologo umano.

Dobbiamo pertanto considerare la possibilità di un rilascio deliberato o involontario di SARS-CoV-2.

Indipendentemente dall’origine della SARS-CoV-2, la in corso della nell’uomo e in altri animali è chiaramente della massima importanza.

Fonti e riferimenti per questo articolo:

Database GISAID ( https://www.gisaid.org/ 87 ) – Virological.org 57 – Wellcome Trust p- ARC Australian Laureate Fellowship (FL170100022) –

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